中国秸秆网综合报道，在党中央、国务院有关政策指引下，在各地政府政策、资金支持下，在众多企业、科研机构的共同努力下，我国秸秆综合利用途径不断拓宽、科技水平明显提高、综合效益快速提升，秸秆“五化”（燃料化、饲料化、肥料化、原料化、基料化）利用的格局已经初步形成。虽然秸秆综合利用工作取得积极成效，露天焚烧现象得到有效遏制，但是还面临着一些亟待解决的问题。
一是政策管理体系有待完善。近年来，我国基本形成了以《可再生能源法》为基础，包括产业规划、实施方案、专项政策、地方政策等在内，集财政补贴、价格优惠、税费减免、用地用电支持等于一体的扶持生物质产业发展的综合性政策框架体系。比如生物质发电优先上网、电网公司全额收购上网电量，各时段、各地区上网统一电价为0.75元/千瓦时；在沼气和生物质天然气建设方面，继续实施中小型沼气工程、户用沼气、沼气服务体系建设补助基础上，重点扶持规模化大型沼气和天然气工程，中央对每立方米沼气生产能力投资补助1500元，对每立方米生物质天然气生产能力补助2500元，单个项目最高补助5000万元。然而，当前秸秆产业的难点在农业，而秸秆产业的出路却分布在工业和其他第三产业，秸秆变身资源和能源，需要一、二、三产业“融合发展”，而这就涉及到发改、能源、农业、环保、住建、科技、经信、自然资源、财政等多个产业主管部门，亟待打通各部门多头管理、“九龙治水”的局面；另外，秸秆产业政策不稳定、变化大，地方上缺乏长远规划，比如有的地区新划定禁燃区，环保部门对秸秆燃料企业“一刀切”，说拆就拆，给秸秆能源化利用造成很大的风险和不确定性；还有一个突出问题就是地方配套资金跟不上。中国农村能源行业协会炉具专业委员会副秘书长任彦波告诉笔者，目前各地几乎都是先利用中央财政资金进行项目启动，招标也只能拿到中央财政资金，地方配套资金根本拿不到，而且三年取消补贴后运维费用更是没有着落，这就为未来的可持续发展带来很大风险。因此，需要出台更为细化、更为长远、更有效果和更有针对性的产业发展政策。
二是科技研发力度仍需加强。秸秆露天焚烧对人体、空气、土壤、交通安全造成危害。秸秆露天直燃在造成大气污染的同时，更重要的是导致地面温度急剧升高，能直接烧死、烫死土壤中的有益微生物，使有机质、腐殖质被矿化，土壤板结变硬，影响作物对土壤养分的充分吸收，影响农业增产、农民增收。中国工程院院士、沈阳农业大学教授陈温福表示，近年来由于不合理不科学的利用模式，我国土壤有机质含量降低，黑土层变薄、酸化现象严重，土壤肥力明显下降，重金属超标。如果不及时治理，东北地区的大部分黑土层将在50年后流失殆尽，南方一些地区红土壤的pH值已低于2.6，重金属污染农田超过3亿亩。他指出，秸秆除了燃料化之外，还可以炭化成生物炭，是指将秸秆在缺氧和一定温度条件下热解形成富炭产品，实现农业秸秆的“碳封存”，变害为宝。如果将14亿吨农林生物质中的一半生产“生物炭”，将产生2亿吨生物炭，约相当于1.5亿吨标准煤，实现经济效益1100多亿元。未来以生物炭为核心的秸秆等农林废弃物资源化综合利用，将成为我国战略性新兴产业，但这方面的科技研发投入需要大力加强，希望国家尽快立项支持生物炭和有着“黑色黄金”美誉的炭基缓释肥暨农林废弃物综合利用技术研究和产业化开发，造福子孙后代。
三是收储、运销体系有待健全。由于秸秆分布广且附加值较低，基于我国小农经济的现实情况，收储运销十分困难。国外都是大型农场，具有较好的信誉和契约精神，很容易形成秸秆上下游的联产联供联销体系。北京化工大学生物质能源与环境工程研究中心主任刘广青表示，由于我国是典型的分田到户到个人的家庭联产承包责任制模式，农业形式呈现小片作业、作物多样的特征，因此秸秆资源大多较为分散，不利于收储和运销。另外，由于我国信用体系建设不足和契约精神的缺失，在收储和运销过程中往往出现坐地起价和漫天要价的现象，使经营企业十分头疼，建议采取多管齐下的制约措施，有针对性地解决收储运销过程出现的难题。建议当前的当务之急是建立健全秸秆收储运销体系，按照秸秆产地合理区域半径就近利用原则，降低收储运销成本，建立以秸秆利用企业和收储组织为核心、经纪人参与、市场化运作的秸秆收储运销体系
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